国内有不少医院院长在是否使用绩效管理系统的决策上，一直犹豫不决，拿不定注意。从上海三慧医院管理中心为国内众多医院实施绩效管理系统的经验看，医院采用绩效管理系统辅助各级管理者管理绩效，有四大理由：
一、管控到位
医院对科室绩效工资总额的一次分配通常都是控制到位的，但是，科室绩效工资的二次分配，往往都没有太好的办法。因为，没有医院绩效管理系统的支持，医院不掌握每一位医护人员的医疗任务完成情况，而要把绩效工资直接核算到职工个人，是不可能的。大多数医院一般仅提出科室绩效工资二次分配的原则和指导方案，科室具体是如何执行的，基本就处于一种失控状态。医院一旦采用绩效管理系统来核算职工绩效工资，就能规范科室绩效工资二次分配过程，从而确保绩效工资分配过程中的公平性、公平性，做到管控到位。
二、管理精细化
“细节决定成败”。医院绩效管理系统的一大功能便是采集his系统、pacs系统、lis系统等中的有关数据，并对这些数据进行分类、归集、汇总、复合计算等。通过医院绩效管理系统，我们可以把每一位医护人员的工作责任具体化、明确化，实时采集他们的工作情况，并对他们的工作成果进行评价，发现问题及时纠正，及时处理。绩效管理系统的应用使得医院实现管理精细化成为可能。
三、管理精准化
绩效管理系统的使用，使得医院职工绩效工资的核算工作实现了一个质的飞跃。在医院采用绩效管理系统之前，科主任或护士长往往都没有工作量、工作质量等有关绩效考核的直接数据，通常都是参照职称高低来分配的。有了医院绩效管理系统，我们就可以看到，每一位职工的绩效工资是如何算出来的，职工所获得每一元绩效工资都跟他或她的哪些工作表现有关。医院绩效管理系统所能做到的管理精准化，常常为医院领导、科主任、甚至普通职工都大为赞叹。
四、解放医疗生产力
临床科室科主任和护士长都是临床一线的业务骨干，但是他们每个月都会为科内绩效工资分配耗费一定的时间和精力。这类时间通常时间少则1天，多则2-3天。医院一旦采用绩效管理系统，科主任和护士长就可以不用在科内绩效工资分配上耗费时间和精力了，而可以把这些时间和精力放在诊疗工作上，放在带教工作上，放在科研工作上。这样，在绩效管理系统的帮助下，医院的医疗生产力就可以进一步提高。
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