现代医院组织结构，既不是一般组织结构（直线制、职能制、直线职能制、矩阵制）中的任何一种类型，也不是一般组织结构之外独特的一种新的类型，而是这四种组织结构类型部分迭加、融合而成的系统化的综合型。在这一系统中，原来独立存在的四种类型，作为系统的要素，被整合在这一系统之中。这就是说，原来独立存在时的某一类型，被整合之后，各自都受其他类型的影响和制约，某一方面得到了强化，另一方面又不得不弱化下来。而在系统的总体功能上，又优于原来独立存在的任何一种类型的功能。所以形成这种新的组织形式，如以组织理论解释，正是现代医院在其系统环境中吸收（或称输入）了“能量”的结果。总结一下，现代医院组织结构有四大特点：
一、直线型组织序列已在层次上缩短
在现代医院组织中，作为垂直序列的顶端，即领导者已不是院长一人，而是由若干副院长参加而形成的领导集团。领导集团垂直领导的组织，已是并列的临床各科室和辅助科室。在科室以下，再无正式序列组织。所以，医院直线垂直领导，只是二级结构。
二、直线职能型组织被保留和发展
个别职能型机关，已垂直领导对临床科室及辅助科室进行物质保障和后勤支援的职能部门，如总务处(科)垂直领导的财务、房舍管理、家俱、水电维修、仓库、食堂、车队等。另外，办公室的信息沟通职能得到了进一步增强，有的已发展为以网络和电子计算机装备起来的指挥、控制中心。
三、职能型组织与参谋型组织相融合
如医院护理部，它负责对全院各临床科室护理工作的指导与监督。如直接隶属于院长，则与医务处（科)相互联系配合进行工作；如隶属于医务处（科)，它则成为参谋型机关中的职能部门。再如，财务室作为一个负责全院各科室财务管理与经办的职能部门，它同时又隶属于总务处(科)这一参谋型机关；由于现在的总务部门直接垂直领导临床、辅助临床科室物质保障与勤务支援的各部门，所以，它已演变成兼有参谋与管理双重功能的部门。但它的管理功能不含临床、辅助临床科室的医疗行政管理。
四、临床科室与辅助临床科室之间的广泛协作
现代医院临床科室与辅助临床科室之间的协作关系联结点，已是矩阵化、网络化。临床各科室，随着临床医学学科的继续分化，而有逐步增加的趋势。临床辅助科室(非临床科室）随着医学诊断、治疗技术的进步，也必将继续增加。各辅助科室都与各临床科室存在着服务、支持性的关系，如麻醉科直接与有手术疗法的各科室协同进行手术。所以，如从临床科室与辅助临床科室的工作关系联结点上看，已完全呈现矩阵化、网络化了。
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